Nació en Schwiebus, Alemania, el día 2 de agosto de 1881. Estudió en Jena y en Berlín en compañía de Adolf Herman Doctorándose en 1904. Trabajó en el Museo de Berlín como egiptólogo. Formó parte del Servicio de Antigüedades Egipcio desde 1907, realizó excavaciones en Nubia copiando los templos de Debod, Kalabsha y Dakka, realizó la catalogación de los santuarios en el Museo de El Cairo. Fue nombrado director del Pelizaeus-Museum, Hildesheim en 1915 desempeñando este cargo hasta 1945. Dirigió los trabajos realizados en Hermópolis entre los años 1929 y 1939. Günter Roeder murió en El Cairo el día 6 de noviembre de 1966.